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Installation d’UIMA sous Linux (… Suite)

  1. Verifying Your Installation (extrait du fichier README dans le répertoire apache-uima)
    To test the installation, run the documentAnalyzer.sh:
    > documentAnalyzer.sh
    This should pop up a Document Analyzer window. Set the values displayed in this GUI to as follows:
    • Input Directory: UIMA_HOME/examples/data
    • Output Directory: UIMA_HOME/examples/data/processed
    • Location of Analysis Engine XML Descriptor: UIMA_HOME/examples/descriptors/analysis_engine/PersonTitleAnnotator.xml
    Replace UIMA_HOME above with the path of your Apache UIMA installation.
    Next, click the Run button, which should, after a brief pause, pop up an Analyzed Results window.
    Double-click on one of the documents to display the analysis results for that document.
  2. View the examples code with Eclipse (extrait du document UIMA Overview & SDK Setup section 3.2. Setting up Eclipse to view Example Code)
    You can create a special project in Eclipse to hold the examples. Here’s how:
    • In Eclipse, if the Java perspective is not already open, switch to it by going to: Window → Open Perspective → Java
    • Select the File Import menu option.
    • Select General/Existing Project into Workspace and click the Next button.
    • Click Browse and browse to the UIMA_HOME directory.
    • Click Finish. This will create a new project called uimaj-examples in your Eclipse workspace. There should be no compilation errors.
    To verify that you have set up the project correctly, check that there are no error messages in the Problems view.
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Installation complète de l’environnement de développement UIMA sous Linux

Ce billet décrit comment installer complètement l’environnement de développement UIMA sous une station de travail Linux sans avoir besoin des droits d’administrateur. Par installation complète il faut comprendre l’installation de tout ce qui est nécessaire : le SDK Java, Eclipse, les plugins nécessaires et le SDK UIMA.

Installation du SDK Java

La première étape consiste, si ce n’est déjà fait, à installer la dernière version du kit de développement de logiciels (SDK) Java. Commencer par télécharger le fichier d’installation (jdk-6u4-linux-i586.bin dans mon cas) dans le répertoire de son choix. Saisir ensuite, dans un shell, en étant dans le répertoire où le fichier a été téléchargé et où l’installation doit se faire :
$ chmod +x jdk-6u4-linux-i586.bin
$ ./jdk-6u4-linux-i586.bin

(Il vous faut répondre yes aux termes du contrat pour réaliser l’installation)

Installation de l’environnement de développement intégré (IDE) Eclipse

Si ce n’est déjà fait, installer la dernière version d’Eclipse (version 3.3.1.1, build id M20071023-1652 au moment de l’écriture de ce billet). L’installation se résume à décompresser à l’endroit de son choix le fichier téléchargé.
Pour exécuter la version d’Eclipse qui vient d’être d’installée avec la version de Java installée précédemment, il faut saisir dans un shell une ligne de commande du style (penser à créer un raccourci) :
$ ~/eclipse/eclipse -vm ~/jdk1.6.0_04/bin/
Ensuite, dans Eclipse, il faut préciser la version de Java qui sera utilisée. Aller dans :
Window → Preferences… → Java → Installed JREs → Add…
Puis préciser :
JRE name : Java jdk1.6.0_04
JRE home directory : ~/jdk1.6.0_04
Valider en cliquant sur Ok, puis penser à cocher la nouvelle version du JRE ajoutée avant de valider de nouveau en cliquant sur Ok.
Vérifier également, la cas échéant, que la variable d’environnement ECLIPSE_HOME est correcte (i.e. désigne bien le répertoire ~/eclipse) dans :
Window → Preferences… → Java → Build Path → Classpath Variables

Installation du plugin Eclipse EMF

Il faut ensuite installer le plugin EMF utilisé par UIMA. En fait, avec la dernière version d’Eclipse, Eclipse Modeling Framework (EMF) Updates apparait automatiquement dans la liste des sites d’installation automatique de plugins (sinon, se référer à EMF Update Manager Site). Une fois Eclipse lancé, il suffit donc de faire :
Help → Software Updates → Find and Install… → Search for new features to install → Next
Puis sélectionner Eclipse Modeling Framework (EMF) Updates, Ignore features not applicable to this environment et Automatically select mirrors puis Finish.
Ensuite déployer Eclipse Modeling Framework (EMF) Updates pour sélectionner EMF SDK 2.3.1 puis :
Next → I accept the terms in the license agreements → Next → Finish → Install All → Yes

Installation du plugin Eclipse UIMA

On peut alors passer à l’installation du plugin Eclipse d’UIMA :
Help → Software Updates → Find and Install… → Search for new features to install → Next → New Remote Site…
Saisir :
Name : Apache UIMA
URL : http://www.apache.org/dist/uima/eclipse-update-site
Puis Ok.
Sélectionner Apache UIMA, Ignore features not applicable to this environment et Automatically select mirrors puis Finish.
Sélectionner Apache UIMA puis :
Next → I accept the terms in the license agreements → Next → Finish → Install All → Yes

Installation du SDK UIMA

Il faut enfin installer le kit de développement de logiciels (SDK) UIMA. Télécharger la dernière version binaire (Binary) du SDK d’UIMA pour java, puis décompresser à l’endroit de votre choix le fichier téléchargé.
Éditez votre fichier .bashrc pour définir les variables d’environnement UIMA_HOME et JAVA_HOME et modifier le PATH en ajoutant les lignes suivante à la fin du fichier (adapter /home/audibert à votre propre installation, mais ne pas utiliser ~ qui cause parfois des problèmes) :
export UIMA_HOME="/home/audibert/apache-uima"
export JAVA_HOME="/home/audibert/jdk1.6.0_04"
export PATH=${PATH}:${UIMA_HOME}/bin

Puis saisir la commande suivante dans un shell pour mettre à jours les chemins des exemples du SDK :
$ adjustExamplePaths.sh
Penser à lire le fichier README dans le répertoire apache-uima pour plus d’information sur l’installation du SDK UIMA ainsi que pour une procédure permettant de tester votre installation (également décrite ici).

Sous Eclipse, vérifier également que la variable d’environnement UIMA_HOME est correcte (i.e. désigne bien le répertoire /home/audibert/apache-uima) dans :
Window → Preferences… → Java → Build Path → Classpath Variables
Si ce n’est pas le cas, il faut la modifier (bouton Edit…) ou la définir (bouton New…).

Si tout s’est bien passé, tous les fichiers concernant l’installation complète de l’environnement de développement UIMA doivent être répartis dans les répertoires apache-uima pour le SDK UIMA, eclipse pour l’environnement de développement intégré Eclipse et les plugins installés et jdk1.6.0_04 pour le JDK Java.

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